CLC Genomics Workbench於基因突變之應用分析
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研討會內容
研討會名稱
CLC Genomics Workbench於基因突變之應用分析
開始日期
2018-01-19 14:00:00
結束日期
2018-01-19 16:00:00
活動說明
CLC Genomics Workbench於基因突變之應用分析
CLC Genomics Workbench為一功能強大之次世代序列分析軟體,其主要功能如下:
可輸入多類型定序儀器High-throughput的定序結果、去除adaptor序列的分析,並混合不同資料格式的定序結果一同進行數據分析。
可進行Reference mapping分析,並支援後續進行SNP、MNP及InDel偵測。
提供Coverage analysis及structure variants分析。
可進行De Novo assembly分析。
具有RNA-Seq分析功能,計算出基因表現量及提供個體間基因表現量高低的比較,進一步提供Heatmap。
可分析Small RNA經次世代測序所獲得的原始數據,並比對miRBase資料庫而得知具有哪些small RNA。
可進行ChIP-seq分析,提供peak finding及鄰近基因的註解功能,並可使用實驗組與對照組資料進行比對分析。
支援使用端的個人電腦提交序列至此資料庫中進行BLAST比對。
可自行建立客製化workflow進行批次自動化的分析。
時間 課程內容
14:00 – 14:30 CLC Genomics Workbench產品於序列分析解決方案之原理及應用介紹
14:30 – 16:00 CLC Genomics Workbench於次世代Resequencing分析之應用介紹及實際操作
一、日期:107/01/19 (五)
二、時間:1400 - 1600
三、地點:杏春樓電腦教室C
四、講師:源資國際生物科技 講師 陳良坤
五、聯絡方式:資訊處 研究資訊組 (02)66382736 轉分機 1614
主要聯絡Mail
nathanlee@tmu.edu.tw, kuancy999@tmu.edu.tw
參考連結
附件檔案