活動摘要

研討會名稱【生醫資訊應用軟體】系列課程II - 整合性基因體分析教育訓練課程: Introduction to Integrative Genomics Viewer for NGS Analysis
開始日期2013-11-13 14:00:00
結束日期2013-11-13 17:00:00
活動說明【生醫資訊應用軟體】系列課程II - 整合性基因體分析教育訓練課程: Introduction to Integrative Genomics Viewer for NGS Analysis

日期:102年11月13日(星期三)14:00-17:00
地點:臺北醫學大學 醫學綜合大樓後棟15樓第一會議室
主講人:劉傳崑 資深經理(國家基因體醫學研究中心)

【講員介紹】
劉傳崑 資深經理
國家基因體醫學研究中心經理

【課程簡介】
IGV(Integrative Genomics Viewer)是Broad Institute為了分析基因序列、基因重複數(copy number)、序列變異、表現量、CHIP-seq和臨床病理資料而開發的NGS及array-based定序資料視覺化瀏覽器。IGV的強項在於提供快速的視覺化界面,將本機端或是網路上的基因體定序資料繪製成圖譜,使用者可以任意放大或縮小瀏覽倍率進行快速搜尋。IGV也能建立定序資料與其他臨床性狀資料的關聯,讓使用者能方便地連結「基因」和「功能」。
為使本校人員能熟悉NGS序列分析之基本工具與基本技術,資訊處研究資訊組於11月13日特別邀請NRPB國家基因體醫學研究中心團隊至本校舉辦教育訓練課程,介紹您如何使用Integrative Genomics Viewer將NGS數據轉換成一目了然的基因圖譜。在此敬邀您參加此課程,並竭誠歡迎您轉發此資訊給有需要的人。

【課程注意事項】
1. 通過本課程得認列教育訓練時數。
2. 本課程包含實作部份,建議攜帶具無線上網功能且有1GB以上記憶體的筆記型電腦一起操作。

【課程內容】
13:45~14:00 Registration

14:00-14:50 Introduction to Integrative Genomics Viewer for NGS Analysis
-如何執行Integrative Genomics Viewer (IGV)?
(劉傳崑 資深經理/蕭方智、吳行中 資訊工程師)

14:50-15:00 Break

15:00-16:30 Introduction to Integrative Genomics Viewer for NGS Analysis
-如何使用IGV瀏覽NGS分析結果?
-介紹NGS分析工具HiPipe與 IGV整合使用的方式
(劉傳崑 資深經理/蕭方智、吳行中 資訊工程師)

16:30-17:00 Q & A
(劉傳崑 資深經理/蕭方智、吳行中 資訊工程師)


*如有相關問題,可連絡張祐誠助理教授(分機3350)或陳俊辰博士(分機3355)
主要聯絡Maildream.chen@tmu.edu.tw
參考連結
報名開始日期2013-10-29 00:00:00
報名結束日期2013-11-13 00:00:00
報名人數35
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