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研讨会内容

研讨会名称【生医信息应用软件】系列课程II - 整合性基因体分析教育训练课程: Introduction to Integrative Genomics Viewer for NGS Analysis
开始日期2013-11-13 14:00:00
结束日期2013-11-13 17:00:00
活动说明【生医信息应用软件】系列课程II - 整合性基因体分析教育训练课程: Introduction to Integrative Genomics Viewer for NGS Analysis

日期:102年11月13日(星期三)14:00-17:00
地点:台北医學大學 医學综合大楼後栋15楼第一会议室
主讲人:刘传崑 资深经理(国家基因体医學研究中心)

【讲员介绍】
刘传崑 资深经理
国家基因体医學研究中心经理

【课程简介】
IGV(Integrative Genomics Viewer)是Broad Institute为了分析基因序列、基因重复数(copy number)、序列变异、表现量、CHIP-seq和临床病理资料而开发的NGS及array-based定序资料视觉化浏覽器。IGV的強项在于提供快速的视觉化界面,将本机端或是网络上的基因体定序资料绘制成图谱,使用者可以任意放大或缩小浏覽倍率进行快速搜寻。IGV也能建立定序资料與其他临床性状资料的关联,让使用者能方便地连结「基因」和「功能」。
为使本校人员能熟悉NGS序列分析之基本工具與基本技术,信息处研究信息组于11月13日特别邀请NRPB国家基因体医學研究中心团队至本校举办教育训练课程,介绍您如何使用Integrative Genomics Viewer将NGS数据转换成一目了然的基因图谱。在此敬邀您参加此课程,并竭诚欢迎您转发此信息给有需要的人。

【课程注意事项】
1. 通过本课程得认列教育训练时数。
2. 本课程包含实作部份,建议携带具无在线網功能且有1GB以上内存的笔记本电脑一起操作。

【课程内容】
13:45~14:00 Registration

14:00-14:50 Introduction to Integrative Genomics Viewer for NGS Analysis
-如何执行Integrative Genomics Viewer (IGV)?
(刘传崑 资深经理/萧方智、吳行中 信息工程师)

14:50-15:00 Break

15:00-16:30 Introduction to Integrative Genomics Viewer for NGS Analysis
-如何使用IGV浏覽NGS分析结果?
-介绍NGS分析工具HiPipe與 IGV整合使用的方式
(刘传崑 资深经理/萧方智、吳行中 信息工程师)

16:30-17:00 Q & A
(刘传崑 资深经理/萧方智、吳行中 信息工程师)


*如有相关问题,可连絡张祐诚助理教授(分机3350)或陈俊辰博士(分机3355)
主要联絡Maildream.chen@tmu.edu.tw
参考连结
附件档案